Desejo Proibido foi o último trabalho do ator Luiz Carlos Tourinho, que interpretava o personagem Nezinho na trama. O ator faleceu, aos 43 anos, durante as gravações da novela, vítima de uma parada cardiorrespiratória, provocada por um aneurisma cerebral.
Após o falecimento do ator Luiz Carlos Tourinho, interprete do personagem Nezinho, Walther Negrão optou, no intuito de dar uma finalidade ao seu persoangem e também a devida homenagem, por usar um dublê do ator em uma cena sobre um burrinho, partindo para uma estreda, deixando o seu colchão cheio de dinheiro para o padre Inácio (Marcos Caruso) investir em obras de caridade.
As primeiras cenas de Desejo Proibido foram gravadas na Estação da Luz, em São Paulo, no início de setembro de 2007.
O sítio Betânia, em Guaratiba, na zona oeste do Rio de Janeiro, foi escolhido como cenário da fazenda do coronel Chico Fernandes (José de Abreu). Já as cenas externas da propriedade de Cândida (Eva Wilma) foram gravadas em um sítio em Três Rios, também no Rio. Com exceção dessas locações, toda a novela foi feita em um espaço cenográfico.