Michael Scofield (Wentworth Miller) é capturado e enviado para Sona, uma prisão panamenha. Diferentemente de Fox River, nessa penitenciária os internos controlam todo o seu funcionamento do lado de dentro, enquanto os guardas ficam armados do lado de fora prontos para atirar em quaisquer possíveis fugitivos. Lechero (Robert Wisdom), assassino, traficante e "chefe" dos presidiários, imediatamente desconfia que a fama de Michael como mestre das fugas ameace sua administração.