Situado em um Japão ficcional no período Edo, entre os séculos XVII e XIX, o anime Samurai Champloo acompanha a jornada do guerreiro breakdance, mas feroz, Mugen (Kazuya Nakai), e o samurai sangue frio e vaidoso Jin (Ginpei Sato), que são reunidos por Fuu (Ayako Kawasumi), uma garçonete de uma casa de chá que acaba sendo destruída por uma confusão causada pelos espadachins. Após resgatar os dois mestres de suas execuções, Fuu pede ajuda para uma tarefa especial: encontrar um samurai que cheira a girassóis. É entre suas diferenças que o trio inesperado de colegas de viagem aprende sobre aceitação e os difíceis caminhos da vida.