Em Invisível, Shimura Takafumi (Takahashi Issei) é um detetive obstinado por justiça e suas atitudes acabam fazendo com que ele seja rebaixado de cargo. Ao entrar para uma unidade responsável por casos não solucionados, ele recebe ordens para trabalhar com Kiriko (Shibasaki Ko), uma mulher conhecida como "Invisível", responsável por várias ações no submundo do crime. Ela faz um acordo com Shimura para prover informações sobre mistérios, até então, sem resposta.