El Desconocido acompanha a jornada fictícia de Cholo Adrián (Guillermo Iván), braço direito de Chato Guzmán (César Manjarrez), líder do cartel de drogas mais poderoso do México. Em sua origem, Cholo nasceu em uma família do narcotráfico e é herdeiro de um antigo nome relevante no mundo do tráfico de drogas, o famoso El Cobra (Mario Zaragoza). Conhecemos Cholo ainda na infância e sua trajetória de ascenção dentro do narcotráfico, sua forte conexão com El Chato e sua má sorte no amor. A série também retrata a morte da modelo e Miss Sinaloa, Susana Flores. Eventualmente, somos apresentados a queda de Cholo, até o momento de sua captura junto ao seu líder.