Em Missing: The Other Side, o vilarejo Duon carrega o espírito de centenas de pessoas mortas e desaparecidas. Kim Wook (Go Soo) é um golpista com uma lábia excelente. No entanto, ao visitar a vila, seus planos começam a dar errado e ele se dá conta de que existe algo muito estranho com o ambiente ao seu redor. Kim Wook conhece Jang Pan-seok (Heo Joon-ho), uma figura misteriosa que, incessantemente, busca por pessoas desaparecidas. Pan-seok é o que conecta o mundo de fora com a Vila, e logo os dois se tornam parceiros na tentativa de resolver os mistérios que envolvem a região. No decorrer dos acontecimentos estranhos, eles se juntam com a funcionária pública e hacker Lee Jong-ah (Ahn So-hee), e o dedicado policial Shin Joon-ho (Ha Jun), que está à procura de sua noiva. Eles irão tentar usar suas habilidades ao máximo para conseguir desvendar os segredos da vila.