Na segunda temporada de SPY x FAMILY, a dinâmica peculiar da família Forger continua a se desenrolar, com mais aventuras e desafios para Twilight, Yor e Anya. Enquanto Twilight segue cumprindo suas missões secretas como espião, a pressão aumenta à medida que a política internacional e os novos inimigos tornam sua missão ainda mais perigosa. Yor, tentando manter sua identidade de assassina em segredo, enfrenta suas próprias dificuldades, enquanto tenta equilibrar sua vida como esposa e mãe, lidando com os altos e baixos de ser parte dessa família falsa que, aos poucos, vai se tornando mais verdadeira para ela. Anya, por sua vez, continua usando seus poderes psíquicos para espiar os outros, criando cenas hilárias e situações complicadas, mas também se aproximando cada vez mais de seu pai e mãe, enquanto vive as aventuras de uma criança normal, apesar dos segredos que cercam sua família.