Bem-Vindos ao Éden retorna para a sua segunda temporada abrindo novos mistérios. Novos integrantes chegam à ilha enquanto os jovens que já estavam presos na comunidade do Éden tentam fugir. Cercados por guardas e sob a vigilância constante de drones, derrubar os fundadores e escapar fica mais difícil a cada dia. Quando uma nova morte é descoberta pelos rebeldes, a situação se intensifica mais ainda, ficando insustentável.