Em Naomi, conhecemos Naomi McDuffie (Kaci Walfall), uma adolescente divertida, confiante e apaixonada por histórias em quadrinhos. Naomi irá embarcar em uma jornada de autoconhecimento depois que um evento sobrenatural abala a pequena cidade onde vive, Port Oswego. Após o ocorrido, sua vida vira de cabeça para baixo. Seus pais, Greg e Jennifer McDuffie (Barry Watson e Mouzam Makkar), estão estranhando o comportamento da filha, que tem desmaiado constantemente. Os amigos próximos de Naomi, um grupo formado por Annabelle (Mary-Charles Jones), Nathan (Anthony Puig), Lourdes (Camila Moreno), Anthony (Will Meyers) e Jacob (Aidan Gemme), resolvem ajudá-la a investigar o mistério por trás do que chocou os militares da região. Eles encontram pistas que envolvem dois figurões da cidade e Naomi percebe que tudo isso é apenas a ponta do iceberg.