Na terceira temporada de Unidade Básica, a UBS precisa lidar com os primeiros casos de Covid-19 em solo brasileiro, com materiais escassos e pacientes desinformados sobre o caso e tratamentos. A incerteza sobre quando a pandemia irá finalizar e a chegada de Mariano (Marat Descartes), o novo gerente da unidade, que apresenta um posicionamento negacionista diante de toda a situação, complicam ainda mais a situação. A presença de Waldir (Rodrigo dos Santos), responsável pela unidade de ambulâncias da UBS, acaba trazendo um conflito entre a relação do casal.