Em sua primeira temporada, Malhação teve como cenário uma academia de ginástica, que dava o nome à série. Héricles (Danton Mello), um rapaz ingênuo do interior, vai para o Rio de Janeiro e arruma um emprego na academia. Lá, ele conhece Isabella (Juliana Martins), uma bela bailarina, e os dois vivem um romance. A temporada aborda temas como racismo, prevenção à AIDS, virgindade, gravidez na adolescência, brigas, pais separados, uso de anabolizantes, tabagismo e outro temas socioeducativos.