Jonathan Lee Miller, também conhecido apenas como Jonny Lee Miller, é um ator britânico com trabalhos diversos no cinema, televisão e teatro. Ganhou proeminência na década de 1990 ao interpretar o personagem Simon Williamson, na comédia dramática Trainspotting - Sem Limites, e Dade Murphy, no filme Hackers - Piratas de Computador.
Lee Miller cresceu no sudoeste de Londres e foi incentivado pelos pais a seguir carreira de ator, já que ambos eram artistas do teatro. Além disso, o seu avô Bernard Lee, era o intérprete do personagem M nos primeiros filmes da franquia 007. Estudou na National Youth Music Theatre, instituição onde conheceu Jude Law.
Entre 2008 e 2009 atuou na série de comédia dramática Eli Stone, interpretando o personagem principal, o que lhe garantiu uma indicação ao prêmio Satellite de melhor ator. Em seguida, estrelou uma versão de Emma para a BBC, e o personagem secundário Jordan Chase na 5ª temporada de Dexter, da Showtime.
Ao longo da década de 2010 foi o protagonista de uma versão moderna de Sherlock Holmes intitulada Elementary para o canal americano CBS, onde atuou ao lado de Lucy Liu e também concorreu a outro prêmio Satellite.