Nas Pegadas de Mengele investiga o que esteva por trás da morte do médico nazista Joseph Mengele, cujos restos mortais foram encontrados no Brasil. O filme busca compreender como o alemão acusado de conduzir experimentos hediondos no campo de concentração de Auschwitz chegou ao Brasil e quais foram seus passos após a Segunda Guerra Mundial, que acabaram culminando em sua morte, em 1985.