Em Através das Sombras, uma jovem assassina de 17 anos chamada Nomi (Aurora Ribero) desafia a organização criminosa na qual trabalha para salvar a vida de um menino de 11 anos. A adolescente cujo codinome é 13, faz parte de um coletivo de assassinos conhecido como A Sombra. Depois de uma missão mal sucedida no Japão, Nomi é suspensa por conduto indisciplinar pelo sua mentora Umbra (Hana Malasan) e é deslocada para a Indonésia. É na cidade de Jakarta que ela encontra por acaso com Monji, um menino que perde sua mãe para uma associação criminosa local. Para salvar a vida de Monji, a rebelde Nomi entra numa cruzada violenta e sangrenta, despertando desavenças e deixando consequências nefastas até para o grupo que a contrata. Deixando destruição por onde passa, Nomi não medirá esforços para ajudar o garoto nessa trama de ação do diretor Timo Tjahjanto.