O Homem de Lagoa Santa acompanha a inusitada trajetória do consagrado pai da paleontologia brasileira, Peter Whilehm Lund (1880-1901). O documentário retrata a vida do naturalista dinamarquês, que viveu 45 anos em Minas Gerais pesquisando fósseis de animais extintos nas cavernas da região de Lagoa Santa. Seu trabalho resultou num levantamento de solo, flora e fauna desde os tempos pré-históricos e culminou com a valiosa descoberta do hominídeo mais antigo da América do Sul: o Homem de Lagoa Santa.