Em Godzilla: Tokyo S.OS., Mothra e as fadas retornam ao Japão mais uma vez com um pedido: devolver Mechagodzilla ao mar junto de Godzilla com a justificativa de que os mortos não podem ser incomodados, caso contrário consequências terríveis virão. Acontece que o aviso veio tarde de mais, uma vez que Godzilla sobreviveu mais uma vez para ameaçar o Japão e está furioso, fazendo com que Mechagodzilla seja a única defesa do país.
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