Doutores da Alegria foi rodado no Instituto da Criança do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP, no Hospital do Mandaqui, no Hospital Cândido Fontoura, no Hospital Albert Einstein e no Hospital do Fundão.
Foram 33 dias de filmagens nos hospitais e outros 16 para as entrevistas. No total o filme levou 7 semanas para ser rodado, tendo gerado 130 horas de material gravado.
Durante as gravações as câmeras foram cobertas por bichos de pelúcia e os operadores foram vestidos como palhaços. Desta forma, as crianças viam a equipe de cinegrafistas como parte do grupo de artistas.
Doutores da Alegria teve o apoio institucional da UNESCO.
Arrigo Barnabé se inspirou na obra de Nino Rota e nos estilos musicais que escutava quando criança para compôr a trilha sonora de Doutores da Alegria.
Parte da renda arrecadada pelo filme nas bilheterias será revertida para os Doutores da Alegria.
Exibido na mostra Première Brasil, no Festival do Rio 2005.