Dois meses depois das filmagens foi feita em Tokaimura (a cena de Godzilla se aproximando da usina nuclear), houve de fato um acidente nuclear lá, em 30 de setembro de 1999, e grande parte da área foi contaminada pela radiação. Isso foi amplamente divulgado na imprensa de todo o mundo. No entanto, decidiram manter a cena como uma advertência contra a energia nuclear, da mesma forma que o Gojira original.
A dublagem em inglês contém homenagens a outros filmes. Por exemplo, "Eu não estou dizendo que não teríamos o nosso cabelo despenteado," é de "Dr. Fantástico" e, "como lixo por um ganso" é de "Patton - Rebelde ou Herói?".
Os monstros mais antigos, Angilas e Rei César, foram considerados como possíveis adversários para o filme.
O primeiro filme em que Godzilla é realmente verde.